Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC94Q9BW85 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms