Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms