Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms