Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PITX2Q99697 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms