Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD3Q96L08 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms