Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COG3Q96JB2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms