Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms