Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP13Q92995 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP13Q92995 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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