Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF4BQ92750 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms