Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms