Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHA9Q7RTU4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms