Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIG3Q6UXM1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms