Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC174Q6PII3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms