Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms