Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PXDC1Q5TGL8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms