Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTXN3Q4LDR2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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