Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RRN3P1Q2M238 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms