Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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