Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP2B3Q16720 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms