Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK3Q16288 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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