Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ZFHX3Q15911 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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