Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TCEA2Q15560 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms