Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NBR1Q14596 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms