Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GTF2H3Q13889 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H3Q13889 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms