Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL3Q13618 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CUL3Q13618 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CUL3Q13618 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL3Q13618 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL3Q13618 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL3Q13618 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CUL3Q13618 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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