Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATRQ13535 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms