Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF5Q13243 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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