Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STRN3Q13033 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STRN3Q13033 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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