Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FOXI1Q12951 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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