Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCB1Q12824 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMARCB1Q12824 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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