Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EP300Q09472 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EP300Q09472 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms