Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms