Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms