Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD3P84022 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD3P84022 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms