Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RPL23P62829 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
RPL23P62829 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RPL23P62829 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms