Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms