Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MTTPP55157 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MTTPP55157 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms