Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LHX1P48742 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LHX1P48742 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms