Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms