Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3CBP42338 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms