Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PPARGP37231 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms