Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRMP28827 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRMP28827 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRMP28827 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRMP28827 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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