Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms