Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGA1P17096 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms