Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMIGD3P0DMS9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms