Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC24AO95486 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24AO95486 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms