Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms