Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBTB1O94844 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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