Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SPAG9O60271 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPAG9O60271 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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