Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms